Elmir Məhəmmədov
Bioinformatika
- Biologiya, BSc, Alberta Universiteti, 2016
- Bioinformatika, MSc, Kopenhagen Universiteti, 2018
- Bioinformatika, PhD, Epigenetika və Kök Hüceyrə İnstitutu, Münxen Helmholtz Mərkəzi (indi)
Bakalavr təhsilim çərçivəsində həyata keçirtdiyim layihə anadangəlmə böyrək və ifrazat sistemi xəstəliklərində bütöv-eksom ardıcıllama analizi yolu ilə yeni genlərin təyin olunmasına fokuslanmışdı. Bunun ardından bioinformatika sahəsi üzrə magistr təhsilim zamanı Berlində yerləşən Nəzəri Biologiya İnstitutunda məməlilərdə sirkadian saat sistemindəki gen-tənzimliyici şəbəkələrin riyazi modelləşdirilməsi üzərinə çalışmalar aparmışam. Daha sonra isə Münxen Helmholtz Mərkəzinin Epigenetika və Kök Hüceyrə İnstitutunda Antionio Scialdone-nin rəhbərliyi altında doktorantura araşdırmalarıma başlamışam. Hazırkı araşdırmalarım hüceyrə taleyinin təyin olunmasını tək-hüceyrəvi transkriptomik analiz yolu ilə öyrənməyə yönəlib. Burada məqsəd məməlilərdə (insan və siçan) inkişaf prosesi zamanı hüceyrə heterogenliyinin mənşəyini tək-hüceyrəvi transkriptomika yolu ilə öyrənməkdir. Bu yeni metodun verdiyi üstünlüklərdən istifadə edərək məməli ürəyində hüceyrə taleyi qərarının verildiyi zaman hüceyrənin molekulyar halını hesablamalı (computation) yollarla təyin etməyə çalışıram. Tək-hüceyrəvi genomika datası hüceyrə heterogenliyi ilə əlaqəli tənzimləyici mexanizmləri, genomdakı funksional domenləri, zaman və məkanda baş verən hadisələri öyrənməyə imkan verir.
- Tyser, R. C.*, Mahammadov, E.*, Nakanoh, S., Vallier, L., Scialdone, A., & Srinivas, S. (2020). A spatially resolved single cell atlas of human gastrulation. bioRxiv.
- Lima, A., Lubatti, G., Burgstaller, J., Hu, D., Green, A., Di Gregorio, A., Mahammadov, E., … & Sanchez, J. M. (2020). Differences in mitochondrial activity trigger cell competition during early mouse development. bioRxiv.